抗原决定簇特指抗原分子上能够与抗体结合位点发生特异性结合作用并决定抗原特异性的部位。所谓抗原的价数实质上就是抗原决定簇的数目。它可以是由连续序列(蛋白质一级结构)组成或由不连续的蛋白质三维结构组成，决定抗原性的特殊化学基团，又称抗原表位。抗原决定簇大多存在于抗原物质的表面，有些存在于抗原物质的内部，须经酶或其他方式处理后才暴露出来。一个天然抗原物质可有多种和多个决定簇。抗原分子越大，决定簇的数目越多。
选择好的抗原决定簇应符合哪些条件?
1.亲水性：大部分抗原决定簇是亲水性的;
2.处于结构表面：大部分抗体只与蛋白质表面部分结合;
3.有弹性：许多已知的抗原决定簇是在自由活动区域。所以一般来说蛋白质的N端及C端是很好的抗原决定簇区域。
